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8个数据库包你搞定ncRNA

随着RNA-seq的广泛应用,2017年lncRNA及circRNA数据呈现出爆发趋势,相关的数据库也在不断更新及完善中。lncRNA方面NONCODE已完成5次更新,并增加亚细胞定位、与甲基化联合分析、SNP变异分析等相关数据库;circ

后GWAS时代,我们如何解读与疾病相关的非编码区SNP?

闰土 2017/11/02

中国医学科学院基础医学研究所、协和医学院基础学院的王晓月教授带领的团队与芝加哥大学的Kevin White实验室合作,使用了一种新方法解析GWAS位点调控基因表达的功能。这项研究于10月23日发表在Genome Biology上。

我国学者改进简化基因测序方法 有效简化基因建库仪器配置

叶问茹 2016/08/10

该技术操作简单灵活、检测成本低、检测通量高,更易被科研人员掌握并能在通用分子实验室中实现,特别适用于需要对大量个体进行SNP标记开发及分型的遗传图谱构建、系统发育分析及群体遗传学等研究

SNaPshot法SNP分型流程

...于荧光标记单碱基延伸原理的分型技术,也称小测序,主要针对中等通量的SNP分型项目。在一个含有测序酶、四种荧光标记ddNTP、紧临多态位点5’-端的不同长度延伸引物和PCR产物模板的反应体系中,引物延伸一个碱基即终止,经ABI测序仪检测后,根据峰的移动位置确定该延伸产物对应的SNP位点,根据峰...

TruSeq DNA PCR-Free LT Sample Prep kit

...,这对于测序具有挑战性的区域,或者鉴别变异特别丰富的区域,以及提高SNP检出的质量都是有好处的。试剂盒包括试剂,样本纯化的beads和index,并且有两种不同规格的试剂盒可供选择。

23andMe发展史:医疗健康领域创业是一种怎样的苦逼体验?

李亦奇 2015/07/26

那就是23andMe的基因检测用的是基因芯片筛查技术,检测的是SNP(Single Nucleotide Polymorphisms,单核苷酸的多态性),而不是像大家熟知的华大基因那样做基因测序。

NIST:首个基因组测序参考标准发布

陈晶晶 2014/02/28

最近,瓶中基因组联盟发布了标准基因型的参考数据集,为人们提供了一组高度可信的单核苷酸多态性(SNP)、插入缺失和纯合子参考基因型的测序检测结果。Zook及其同事在近期的Nature Biotechnology杂志上发文对此进行了描述。

基因变异是疾病的罪魁祸首?

杜焱恭 2013/10/05

有的人吸烟喝酒却长寿,也有人自幼就病痛缠身;同一种治疗肿瘤的药对一些人非常有效,对另一些人则完全无效。这与SNP有关。SNP与疾病有怎样的关系?中科院甄二真教授为我们揭开了SNP的神秘面纱。

Science: 基因芯片正走向临床

张祥瑞 2013/08/12

由于其高通量的信息收集能力可检测特定疾病的遗传变化,目前基因芯片已开始转向临床应用,市场上也出现了一些公司,可提供各种功能的基因芯片,如牛津基因科技公司的CytoSure ISCA 、PerkinElmer公司的OncoChip、昂飞公司的CytoScan HD以及安捷伦公司的CGH&SNP芯片等。

松下研发出1小时即可完成检测的基因检测芯片

Pobeeshao 2013/02/20

1小时即可完成检测的全自动小型基因检测芯片由松下与比利时微电子研究中心(IMEC)共同研发出,能利用数μL血液来检测SNP等基因信息,从而诊断有无遗传病及将来患遗传病的危险率,并可确定与疾病相关的基因。